本校前身為國立屏東農業專科學校，設校之宗旨在培育國內農業相關產業
所需各方面人才為主，並協助政府推動各項農業政策及發展農產事業，改進所
需相關研究與發展，因而設立與農業工程相關之科系。於民國八十六年八月更
名為「國立屏東科技大學」，工學群則組織成立為工程科技學院(簡稱工學院)
，包括： 
環境工程與科學系 ﹝二年制、四年制、碩士班、進修部二年制﹞
機械工程系 ﹝四年制、二年制、碩士班、進修部二年制﹞
土木工程系 ﹝二年制、四年制、碩士班、進修部二年制﹞
水土保持系 ﹝四年制、碩士班﹞
車輛工程系 ﹝ 四年制、二年制、碩士班、進修部二年制﹞
生物機電工程系 ﹝四年制、碩士班、進修部四年制﹞